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綠孔雀腸道菌群基因組特征和耐藥性的宏基因組測序分析

西南林業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)) 頁數(shù): 8 2024-09-18
摘要: 為明確綠孔雀腸道菌群耐藥基因及可移動元件的分布特征,對云南野生動物園,開放式飼養(yǎng)的健康綠孔雀糞便采樣,提取其DNA后進(jìn)行宏基因組測序。使用NCBI-nr數(shù)據(jù)庫進(jìn)行物種注釋及相對豐度計算,得出綠孔雀腸道菌群物種分布特征;通過功能注釋及聚類分析,得出耐藥基因的類型及分布特征。使用BLAST程序搜尋樣本中的可移動耐藥基因,并與不同的地域、宿主和體位的細(xì)菌基因組進(jìn)行對比,分析其差異及近... (共8頁)

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